• [August 8] Als je één van de practicumopgaven wilt overmaken, kan dat op elk moment tussen nu en 23 augustus. Maak de opgave opnieuw en lever deze volgens hetzelfde format in via email bij de docent. Doe dan meteen een voorstel voor nabespreking. Lukt 23 augustus niet, overleg dan even. De start van blok 1 (9 september) is wel een absolute deadline.
• [July 8] Resultaten tot nu toe. Onder T staat het tentamenresultaat, nog zonder verwerking van de practicumresultaten. Links daarvan de punten per opgave. Inmiddels is P3 toegevoegd (9 juli).

Het venijn zat in opgave 1 (iii) [4 punten] en 2 (i) [8 punten]. Bij 1 (iii) werden wel heel gemakkelijk enorme lijsten gematerialiseerd in de server. Bij 2 (i) zag ik de merkwaardigste algebraïsche capriolen: hoe tel je een vector bij een matrix op? Gelukkig had niet iedereen de convergentieproblematiek uit het oog verloren.

• [July 1] <CORRECTIE> De planning voor de laatste week. Op donderdag tussen 15:30 en 17:30 uur is er gelegenheid tot inzage van opgave 3. René zit dan in BBL 103 (of daar in de buurt). Opgave 3 wordt op de klassieke manier gecorrigeerd. Je hoeft geen afspraak te maken voor een demo. Het tentamen duurt van 13:30 tot 16:00. Ik wil het tentamen op vrijdag 8 juli nagekeken hebben.
• [June 29] Hier vind je een aantal opgaven die representatief zijn voor wat je op het tentamen kunt verwachten. Zoals je ziet mag je een spiekbriefje gebruiken.
• [June 17] Materiaal betreffende Pagerank toegevoegd.
• [June 7] DEADLINE EXTENSION voor opgave 2: dinsdag 14 juni.
• [May 26] Opgave 2 toegevoegd.
• [May 20] HINT: Monet lijkt problemen te hebben met condities als "a - b = c - d". Een mogelijke workaround is dat je queries opsplitst:

CREATE TABLE temp1 AS SELECT .... WITH DATA;

CREATE TABLE temp2 AS SELECT .... WITH DATA;

Omdat de Monet query processor in principe deelresultaten materialiseert, is dit niet zo'n gekke tactiek. Wel de rommel opruimen natuurlijk.

• [May 19] Er is vraag naar BLOSUM62. Mijn c-code voor het aanmaken van p3pairs bevat deze matrix. De laaste vier letters zijn geen aminozuren maar speciale codes.
• [May 10] Er was vraag naar meer bronnen over Blast. Ik denk dat deze informatief is.Verder zijn wellicht deze slides interessant.
• [May 10] Als het installeren van Monet/SQL niet lukt, gebruik dan SQLite.
• [May 10] Je wordt geacht de practicumopdracht in koppels te doen, maar je mag ook alleen werken.
• [May 10] Op de practicumdagen (dinsdag en donderdag) ben ik van 9 tot 17 bereikbaar via email of gsm: 06 30808983. Op ander dagen mag je ook vragen stellen, maar dan garandeer ik geen korte responstijd.
• [April 28] In de week van 2 mei is er geen onderwijs.
• [April 28] De link naar de sesam-directory werkt weer; usr=adb.
  • wat was het password ook al weer
• [April 28] Het practicum begint op 10 mei. Dan is er geen college (zie ook schedule). Op de practicumdagen is Hans (in principe) van 9 tot 17 beschikbaar voor assistentie, voornamelijk via email.
• [April 28] Ik zal ernaar streven om de verwijzingen naar het studiemateriaal vóór het college op de site te zetten.
• [April 21] Site is aangepast aan het studiejaar 2010/2011.